Package org.jmol.api

Interface JmolPropertyManager

  • All Known Implementing Classes:
    PropertyManager

    public interface JmolPropertyManager
    • Method Summary

      All Methods Instance Methods Abstract Methods 
      Modifier and Type Method Description
      boolean checkPropertyParameter​(java.lang.String name)  
      java.lang.Object extractProperty​(java.lang.Object property, java.lang.Object args, int pt, javajs.util.Lst<java.lang.Object> v2, boolean isCompiled)  
      java.lang.String getAtomData​(java.lang.String atomExpression, java.lang.String type, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getChimeInfo​(int tok, BS selectionSet)  
      java.lang.String getDefaultPropertyParam​(int propertyID)  
      java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getLigandInfo​(java.lang.Object atomExpression)  
      java.lang.String getModelCml​(BS bs, int nAtomsMax, boolean addBonds, boolean doTransform, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getModelExtract​(BS atomBitSet, boolean doTransform, boolean isModelKit, java.lang.String type, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getModelFileInfo​(BS visibleFramesBitSet)  
      java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getModelInfo​(java.lang.Object atomExpression)  
      java.lang.String getPdbAtomData​(BS bs, javajs.util.OC out, boolean asPQR, boolean doTransform, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getPdbData​(int modelIndex, java.lang.String type, BS bsA, java.lang.Object[] parameters, javajs.util.OC oc, boolean addStructure)  
      java.lang.Object getProperty​(java.lang.String returnType, java.lang.String infoType, java.lang.Object paramInfo)  
      int getPropertyNumber​(java.lang.String name)  
      void setViewer​(Viewer vwr)  
    • Method Detail

      • setViewer

        void setViewer​(Viewer vwr)
      • getProperty

        java.lang.Object getProperty​(java.lang.String returnType,
                                     java.lang.String infoType,
                                     java.lang.Object paramInfo)
      • getDefaultPropertyParam

        java.lang.String getDefaultPropertyParam​(int propertyID)
      • getPropertyNumber

        int getPropertyNumber​(java.lang.String name)
      • checkPropertyParameter

        boolean checkPropertyParameter​(java.lang.String name)
      • extractProperty

        java.lang.Object extractProperty​(java.lang.Object property,
                                         java.lang.Object args,
                                         int pt,
                                         javajs.util.Lst<java.lang.Object> v2,
                                         boolean isCompiled)
      • getModelInfo

        java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getModelInfo​(java.lang.Object atomExpression)
      • getLigandInfo

        java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getLigandInfo​(java.lang.Object atomExpression)
      • getModelFileInfo

        java.lang.String getModelFileInfo​(BS visibleFramesBitSet)
      • getChimeInfo

        java.lang.String getChimeInfo​(int tok,
                                      BS selectionSet)
      • getModelExtract

        java.lang.String getModelExtract​(BS atomBitSet,
                                         boolean doTransform,
                                         boolean isModelKit,
                                         java.lang.String type,
                                         boolean allTrajectories)
      • getPdbAtomData

        java.lang.String getPdbAtomData​(BS bs,
                                        javajs.util.OC out,
                                        boolean asPQR,
                                        boolean doTransform,
                                        boolean allTrajectories)
      • getPdbData

        java.lang.String getPdbData​(int modelIndex,
                                    java.lang.String type,
                                    BS bsA,
                                    java.lang.Object[] parameters,
                                    javajs.util.OC oc,
                                    boolean addStructure)
      • getModelCml

        java.lang.String getModelCml​(BS bs,
                                     int nAtomsMax,
                                     boolean addBonds,
                                     boolean doTransform,
                                     boolean allTrajectories)
      • getAtomData

        java.lang.String getAtomData​(java.lang.String atomExpression,
                                     java.lang.String type,
                                     boolean allTrajectories)