Class Hierarchy
- java.lang.Object
- pal.datatype.CodonTableFactory
- pal.datatype.CodonTableUtils
- pal.datatype.DataType.Utils
- pal.datatype.DataTypeTool
- pal.datatype.IUPACPenaltyTable (implements pal.datatype.TransitionPenaltyTable)
- pal.datatype.MolecularDataType.Utils
- pal.datatype.SimpleDataType (implements pal.datatype.DataType)
- pal.datatype.AminoAcids
- pal.datatype.SpecificAminoAcids (implements pal.datatype.MolecularDataType)
- pal.datatype.Codons (implements pal.datatype.MolecularDataType)
- pal.datatype.GapBalanced (implements pal.datatype.MolecularDataType)
- pal.datatype.IUPACNucleotides (implements pal.datatype.AmbiguousDataType, pal.datatype.MolecularDataType)
- pal.datatype.Nucleotides (implements pal.datatype.MolecularDataType)
- pal.datatype.NumericDataType
- pal.datatype.StateRemover (implements java.io.Serializable)
- pal.datatype.TwoStates
- pal.datatype.AminoAcids
Interface Hierarchy
- java.io.Serializable
- pal.datatype.CodonTable
- pal.datatype.DataType
- pal.datatype.AmbiguousDataType
- pal.datatype.MolecularDataType
- pal.datatype.TransitionPenaltyTable